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LAMPseq bietet innovative genetische Erregernachweise im Hochdurchsatzverfahren
Mit der LAMPseq-Technologie werden die Nukleinsäuren der Pathogene in einem einzigen Lyseschritt freigesetzt. Damit werden Zeit und Kosten für ein zusätzliches Aufreinigungsverfahren eingespart. Im Anschluss folgt die Amplifikation der Zielregion mittels Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP). Die LAMP-Reaktion nutzt eine spezielle DNA-Polymerase, sechs Primer pro Zielregion und ermöglicht eine sensitive, spezifische und isothermale Amplifikation der Zielregion. Ursprünglich für den Nachweis von SARS-CoV-2 entwickelt, ermöglicht das unser neues Multiplexing-System die Erkennung mehrerer Pathogene in einem Reaktionsansatz.
LAMPseq verbindet isothermale Amplifikation mit Next-Generation Sequencing
Die LAMPseq-Technologie verwendet Primer, die mit einzigartigen molekularen Barcodes versehen sind und bei der Amplifikation der Zielregion in das Produkt der LAMP-Reaktion eingebaut werden. Im Hochdurchsatzverfahren wird eine Bibliothek mit LAMP-Produkten erstellt und mittels Next-Generation-Sequencing (NGS) sequenziert. Die Sequenzierung der molekularen Barcodes ermöglicht die zuverlässige Identifikation einzelner Proben aus einem Pool von tausenden Proben.
Die LAMPseq-Software begleitet die Durchführung, analysiert die Sequenzierungsdaten und erstellt Testergebnisse, die Auskunft über den Pathogenstatus geben.
Die Sensitivität der LAMPseq-Technologie ist vergleichbar mit der quantitativen PCR (qPCR)und liefert zusätzlich wichtige Sequenzinformationen, die für die Identifikation von Pathogenvarianten und resistenzvermittelnden Mutationen genutzt werden können.
Auch im Verfahren der Liquid Biopsy könnte die LAMPseq-Technologie zukünftig eine Anwendung finden. Unsere hochsensitive Methode wird für den Nachweis von zirkulierenden Tumorzellen oder zellfreier DNA im Blut getestet, um in Zukunft die Früherkennung von Krebs oder Vorhersagen über das Metastasierungsrisikos durch Blutproben zu ermöglichen.
LAMPseq optimiert den Durchsatz bei geringen Geräte-, Raum- und Personalkosten
Ablauf
Die Proben durchlaufen im Labor mehrere Prozessschritte: Lyse, Flüssigkeitstransfer, LAMP-Reaktion, Quantifizierung, Sequenzierung, Analyse und Ergebnisübermittlung.
Personal- und Zeitaufwand
Zwei technische Assistent*innen führen den gesamten Prozess von der Lyse bis zur Sequenzierung selbstständig und innerhalb kurzer Zeit durch. Die Sequenzierung erfolgt über Nacht, wodurch die Ergebnisse am Folgetag vorliegen.
Kosten
Als Hochdurchsatzverfahren bietet die LAMPseq-Technologie attraktive Preise. Die Gewinnmarge nimmt mit dem Probenaufkommen zu. Geringe Geräte-, Raum- und Personalkosten minimieren das erforderliche Startkapital.
